宇佐駅の西約3.5km、国道10号の南側に社叢が広がる。豊前国一の宮であり、全国4万社余りある八幡社の総本社。伊勢神宮に次ぐ宗廟として朝廷から崇敬を受けた屈指の名社である。
　寄藻川にかかる神橋を渡ると樹木の多い整然とした境内が菱形池を中心に広がる。広さ約50万m²、イチイガシなどの大樹がうっそうと茂る最奥の亀山に鎮まる朱塗柱、白壁の鮮やかな上宮をはじめ、下宮・頓宮や、若宮神社など境内全域に配されている。
　本殿は、向かって左から一之御殿、二之御殿、三之御殿と並び、一之御殿から順に、国家鎮護や厄除開運として知られる。八幡大神（はちまんおおかみ）、財運や交通安全の神である比売大神（ひめおおかみ）、そして安産や教育を守護する神功皇后（じんぐうこうごう）の三神を祀っている。
　社伝によれば、725（神亀2）年に本殿の一之御殿が創建されたのに始まるという。以来朝廷の崇敬厚く、現在に至るまで勅使が派遣され、749（天平21）年には奈良の東大寺大仏造立に際しても神助が仰がれている。特に769（神護景雲3）年には和気清麻呂＊が八幡大神の神託により弓削道鏡を退けたことは有名である。859（貞観元）年朝廷守護のため石清水八幡宮が勧請された。30年ごとの式年造営も定められたが、南北朝の争乱で荒廃。応永年間（1394～1428年）に大内義弘により造営された。
　また、738（天平10）年には、全国で初めて境内に神宮寺が建立され神仏習合の先駆としても知られる。国東半島に広がる山岳信仰・六郷満山文化と深い関わりを持つ。