＊1 日本最初の官寺として造営：仏教伝来にともなって崇仏派の蘇我馬子に味方して排仏派の物部守屋を倒そうとした聖徳太子が戦勝祈願をして四天王寺造営を誓った。このとき馬子も飛鳥寺の造営を誓い、588（崇峻天皇元）年から建設を始めている。
＊2 西門（石鳥居）：境内の南西に立つ石造の明神鳥居で、1294（永仁2）年忍性（にんしょう）の建立。この門は浄土思想の影響で西方極楽浄土の東門であると考えられるようになり、彼岸の中日に真西に沈む太陽を拝し極楽浄土を思う日想観の修行がなされた。鳥居中央に｢釈迦如来、転法輪処、当極楽土、東門中心｣の銅の額が掲っている。
＊3 金堂：1961（昭和36）年、五重塔・講堂とともに創建当初の飛鳥時代の様式をとり入れて再建された。内部の壁画は中村岳陵画伯の筆になり、5題12面からなる壁画でお釈迦さまの一代を描いた壮麗な作品。本尊は救世（くぜ）観世音菩薩像。また五重塔は相輪が塔の高さの3分の1もあり、安定した姿である。
＊4 再建復元：第2次大戦中の空襲で焼失後発掘調査によって、当初の礎石や排水遺跡から主要伽藍が南北一直線に置かれていたこと、その境域が高麗尺で方1000尺（約300m）であり、現在と相違のないことが確認された。国の史跡地に指定。
＊5 六時堂：1623（元和9）年造営。816（弘仁7）年に伝教大師最澄により創建された。桁行七間、梁間五間、一重、入母屋造、本瓦葺。
＊6 元三大師堂：1623（元和9）年造営。もと椎寺普門院と呼ばれる。江戸中期頃から元三大師堂となった。元三大師は平安時代の僧侶。第十八代天台座主。名を良源、諡号を慈恵大師。985（寛和元）年正月三日に遷化したので、「元三大師」とも呼ばれるようになった。桁行三間、梁間三間、一重、寄棟造、本瓦葺。
＊7 扇面法華経冊子：扇型の料紙に人物や花鳥を極彩色で下絵し、法華経を写経している。絵は大和絵の技法を用い藤原時代の優麗さをたたえながら、画題は『万葉集』や『古今和歌集』などに依拠する場面、井戸端で洗濯する女たちや市場の風景という多彩さである。当時の風俗を知る上で貴重で、平安時代に流行した装飾経典のうちでも傑作と評価されている。
＊8 懸守：紐をつけて首からかける御守りのことで、女性や子供が旅の道中に携帯した。聖徳太子が所持していたと伝わるが、平安文化特有の繊細で華麗な文様が施されている。
＊9 七星剣：丙子椒林剣（へいししょうりんけん）とともに聖徳太子の佩刀（はいとう）といわれ、飛鳥時代の直刀である。七星などを金象嵌しているが、この文様の類例は正倉院御物の杖刀などにもみられる。