＊身延山：身延の名は、甲斐国志によると、古歌に「わすれては雨かとそ思ふ瀧の音にみのふの山の名をやからまし」とあり、西行法師も「雨しのぐみのふの里」と詠んでいることから、「蓑夫」の意味であったとし、日蓮がその字を「身延」に改めたと伝えられている、と記している。
＊日蓮宗：日蓮（1222年～1282）年は安房小湊に生まれ、清澄寺、比叡山などに学ぶ。1253（建長5）年に南無妙法蓮華経の題目を称え日蓮宗を開宗し、1260（文応元）年に『立正安国論』を著す。数度にわたる鎌倉幕府への諫言を行ったため弾圧をうけ、佐渡などへ配流された。その危難を乗り越え、1274（文永11）年から身延山に入山し草庵を構え『撰時鈔』、『報恩鈔』など多くの著述を残した。1281（弘安4）年には、草庵を廃して本格的な堂宇を建築し、「身延山妙法華院久遠寺」と自ら命名した。1282（弘安5）年まで9年間、身延山に留まったが、同年、武蔵国池上（東京都大田区）にて入寂した。
＊総門：28世日奠上人が1665（寛文5）年に建立したと伝えられる。36世日潮上人の染筆になる扁額の「開会関」は全ての人々が法華経のもとに救われる関門という意味。
＊三門：1907（明治40）年に再建された高さ約21mの門。間口は廊門を加えて約42m、重層、総欅造の大建築である。左右には仁王、楼上に十六羅漢像を安置する。
＊菩提梯（ぼだいてい）：三門につづく石畳から真直ぐに登る急な石段。17世紀半ば、佐渡の仁蔵とその子孫数代によって造られたといわれる。総高約105m、287段の石段は題目の7字にちなんで7区分されている。左右に男坂と女坂がある。
＊本堂（地下に宝物館）：本堂は1875（明治8）年の大火で焼失。1985（昭和60）年、日蓮聖人700遠忌の主要記念事業として再建された。間口32メートル、奥行51メートル。地下の宝物館には国宝の徽宗皇帝筆『絹本着色夏景山水図』や国の重要文化財『宋版礼記正義図』をはじめ、日蓮直筆と伝える『曼荼羅本尊』や日本最古の返点つき法華経といわれる『心空嘉慶点法華経』など約40点を所蔵、展示している。（入替あり）
＊御真骨堂：御真骨堂は1881（明治14）年の建立。拝殿は木造平屋建、銅板葺き。御堂は土蔵造りの八角円堂で、日蓮の遺骨を納める。同所に安置する四天王像は後藤祐乗（ゆうしよう）の作と伝えられる。御真骨堂に向かって左には日蓮の像を祭る祖師堂、右には仏殿納牌堂・大客殿、江戸時代の名園をもつ水鳴楼などがつづく。正面には開基堂と呼ばれる多宝塔がある。
＊五重塔：1875（明治8）年に焼失したが2009（平成21）年に再建。木材は全て国産を使用し、400年前に建てられたという元和の塔を忠実に復元・再建した。
＊草庵と御廟：草庵跡は石柵に囲まれており、その右奥に日蓮の廟所がある。「何処にて死に候（さぶらふ）とも墓をば身延山にたてさせ給へ、未来際までも心は身延山に住むべく候」との日蓮の遺志によってこの地へ葬られた。近くに六老僧（日蓮の高弟、日昭・日朗・日興・日向・日頂・日持）や歴代身延山住持の墓が並んでいる。
＊奥ノ院：身延山頂にあり、思親閣が建つ。日蓮がこの峰より両親を追慕したといわれ、日蓮没後、弟子日朗によって堂宇が建立された。山頂よりの眺めは脚下に富士川、その奥、東には富士山が覗く。西北には七面山、その先には南アルプス連峰を望む。