森に分け入るような土佐の植物生態園がアプローチとなり牧野富太郎記念館へいざなわれる。記念館は建築家・内藤廣の代表作に数えられる建物（村野藤吾賞受賞作）で、台風銀座高知の山上にふきつける風雨に耐えるべく風工学の実験をしながらデザインされた。庇の低い地に伏せたような建物の周りには職員が集めた牧野博士ゆかりの樹木などが植えられていて、それらが伸びていくにしたがい建物と周辺の環境がより強靭性を増していく。庭園中央部では、段々畑だったような斜面に開かれた園地の立体的な造形と通路の妙により、趣異なる風景が次々と観覧者の前に現れる。
　1999（平成11）年リニューアル時に全体の庭の形を託された稲田純一はシンガポール政府の庭園的都市開発に携わってきた造園家。リニューアル後も「五〇周年記念庭園」（2008（平成20）年）や新温室建造（2010（平成22）年）をてがけた。温室入口付近はアコウなどが植栽された太古の洞窟のような9mの塔で、園内でも特にフォトジェニックな空間として知られている。南園の「お馬道」は、民謡「よさこい節」にかんざしを買ったと唄われた僧、純信のいた南の坊と想い人、長江のお馬の生家をつなぐ旧来の道。洗濯物を持ってお馬が通ったという。