県営バス・長崎バスで天主堂下・センター前・神学校前下車、徒歩すぐ。長崎市の浦上地区にある。
　浦上は長崎開港当時、幕府と有馬氏のキリシタン領となったところで、歴史的にキリスト教の影響が強く、キリスト禁教後も多くの信徒が潜伏して信仰を続けていた。1865（元治2）年、浦上の潜伏キリシタンが大浦天主堂を訪れ、自分たちの信仰を告白した。この「信徒発見」後、1867（慶応3）年に浦上四番崩れ＊と呼ばれる大規模な弾圧が起こり、約3,400人の浦上信徒全員が各地に流配となった。拷問や苦役を受け、亡くなる信徒も多かった。
　1873（明治6）年、かつてキリシタン弾圧が行われた庄屋屋敷を買い取り、仮聖堂とした。後、浦上に戻った1,900人を中心に教会堂建設が計画された。1915（大正4）年に献堂式が挙げられた後、1925（大正14）年に2つの鐘楼がつけられ、起工から30年を経てようやく完成した。石と煉瓦造りのロマネスク様式で、その荘厳さと美しさと規模から「東洋一の大聖堂」と称された。
　1945（昭和20）年の原爆、浦上天主堂近くが爆心地で、教会ほか周辺は全壊、8,500名の信徒が亡くなった。1959（昭和34）年に新しい天主堂が再建され、現在に至っている。250年もの間、守り続けた信仰の復活を浦上の信徒が実現させたことで、特別な聖堂として、1962（昭和37）年、大浦天主堂に代わり、司教座聖堂に指定された。その後、ローマ教皇の来日前に改装され、1980（昭和55）年、煉瓦のタイル張りの姿になった。上五島町の鯛ノ浦教会が1949（昭和24）年に、レンガ造りの鐘塔が増築されたとき、ここの被爆煉瓦が使用された。　
　歌謡曲界で、名曲の誉れ高い「長崎の鐘」は、浦上天主堂や被爆した永井博士など、浦上を歌ったもの。作詞サトウハチロー　作曲古関裕司　歌藤山一郎。永井博士には「長崎の鐘」の随筆がある。