本土と島後島（隠岐の島町）の玄関口である西郷港から北西へ13km、車で25分の五箇地区にある。
　延喜式神名帳に名神大社と記されている隠岐国一宮。祀られている水若酢命は、隠岐の国土開発と日本海鎮護をされた神様だと伝えられている。社伝によると創建は仁徳天皇（在位は5世紀前半ごろ）の時代と言われている。
　1795（寛政7）年に再興された本殿は、大社造に春日造を加味した、隠岐特有の隠岐造といわれる独特なもので、国の重要文化財に指定されている。
　境内には、樹齢300年を越えるクロマツが建ち並んでいる。参道脇には映画「渾身KON-SHIN」＊の舞台ともなった土俵が設けられており、20年に1度の本殿屋根の葺き替え時には、夜を徹した「隠岐古典相撲」が行われる。
　西暦偶数年の5月3日には「水若酢神社祭礼風流」が開催される、日本古来の山車が曳かれ、流鏑馬などの神事が行われる。5月3日、山曳き（やまひき）神事が祭りの幕開けとなる。曳くのは8歳くらいまでの男児で、他郷で暮らす出氏子（でうじこ）の子供たちもこの日のために両親に連れられ帰って来る。それぞれ揃いのたすき、鉢巻、わらじをはいて親たちに手を引かれ、あるいは背負われてこの行列に参加する。山車が御旅所に到着すると、棧敷では獅子舞、一番立、大楽、浦安の舞と続く。一方、馬場では悪霊の退散と五穀豊穰を願って流鏑馬の神事が行われる。