本土と島後島（隠岐の島町）の玄関口である西郷港から車で5分のところにある。
　隠岐の総社として創建された延喜式神名帳に記載の古社。社伝によると景行天皇が皇子を各国に分離した際に隠岐に遣わされた大酢別命の御子が玉若酢命だと伝えられている。宮司を務める億岐家は「隠岐国造」 の家系で、億岐家に保管されている隠岐国駅鈴＊と隠伎倉印＊は国の考古資料に指定されている。
　現在の本殿は、1793（寛政5年）の建築で、様式は大社造に春日造を加味した、俗に隠岐造といわれる独特なものである。南向き切妻、妻入り茅葺で、中央に片流れの向拝がついている。本殿と旧拝殿と随神門は、国の重要文化財に指定されている。
　社殿の前には、樹齢2000年といわれる高さ29m、目通りの周囲10m、日本でも有数の巨木・八百杉（やおすぎ）＊があり天然記念物に指定されている。
　神社の前方の高台は、国府の跡と想定される。神社の北西側の丘陵には、前方後円墳1基（8号墳）と円墳14基の計15基からなる玉若酢命神社古墳群がある。
　6月の例祭では、馬入れ・神幸・お田植・流鏑馬（やぶさめ）などが繰りひろげられる。