＊南大門：蓮華王院（三十三間堂）の西門であったのを、1895（明治28）年に移築した。切妻造、本瓦葺、3間1戸の雄大な八脚門である。蟇股（かえるまた）の鳥獣の彫刻などに桃山建築の特色がうかがえる。
＊金堂：1603（慶長8）年、豊臣秀頼の再建。正面7間、側面5間、重層、入母屋造、本瓦葺。平面の大きさは創建時のままである。下層正面の屋根の中央を一段高くしているのは奈良の東大寺大仏殿の古制にならったものといわれる。下層に天竺様の挿肘木（さしひじき）を用い、上層の斗拱（ときょう）に和様四手先を組むなど、細部に和様・唐様・天竺様の手法を巧みに折衷している。内部は四半（しはん）瓦敷の内・外陣からなり、内陣後方の須弥壇に薬師三尊像（桃山時代）を安置する。
＊講堂：1491（延徳3）年再建。正面9間、側面4間、単層、入母屋造、本瓦葺の純和様建築。金堂と同じく旧堂の位置に平面の大きさをそのまま受け継いでいる。内部には立体曼荼羅の世界が広がる。
＊食堂（じきどう）：講堂の北にある。創建は平安時代。江戸時代に再建されたが1930（昭和5）年に焼失、現在のものは1933（昭和8）年の再建。もとは聖僧文殊坐像（貞観時代）・地蔵菩薩立像（貞観時代）・千手観音立像（藤原時代）を安置していた。正面7間、側面4間、単層、入母屋造。
＊仏・法・僧：金堂は「仏」に出会う場所。講堂は「法」に出会う場所、食堂は「僧」たちが切磋琢磨する場所。
＊講堂内の彫像群：金堂が顕教（けんきょう）系薬師如来坐像を本尊とするのとはまったく対照的に、内陣須弥壇は空海の密教思想を存分に盛りこんだ羯磨曼荼羅（かつままんだら）が21躯の彫像によって構成されている。このうち、16躯が国宝、5躯が国重要文化財。中央に大日如来を中心とする五智如来、右に五大菩薩と左に五大明王を配し、両端に梵天（ぼんてん）と帝釈天、四隅に四天王を巡らす配置は奈良時代には見られなかった新形式である。この諸尊は護国のための仁王経曼荼羅を具体的に表わしたもので、教王護国寺の寺号もこの講堂の構成に基づくものとされる。中央の大日如来は室町時代、四方の如来と五大菩薩の中尊は江戸時代の補作だが、残り16躯は創建当時のものである。いずれも一木造漆箔（しっぱく）または彩色、貞観彫刻の秀作。ことに五大明王像は密教彫刻の精粋といわれる傑作である。
＊灌頂院：儀式を行うための堂で、床は石畳、内部に仏像は安置されていない。密教の奥義を伝えるための「伝法灌頂」や、鎮護国家、五穀豊穰、国土豊穰を祈願する「後七日御修法（ごしちにちみしほ）」などが行われる。現在の建物は、1634年（寛永11年）、弘法大師八百年御遠忌のときに徳川家光によって再建された。
＊御影堂（大師堂）：境内の西北にある。正面7間、側面4間、単層、入母屋造、三方に破風をもつ檜皮葺の屋根。前堂・後堂に分かれた複雑な形の住宅風建築で、外面に蔀戸（しとみど）や妻唐戸を使って寝殿造の形式を見せている。前堂の弘法大師坐像（鎌倉時代、国宝）には毎朝6時、食事を捧げる「生身供（しょうじんく）」や、毎月21日に空海のご遺徳を偲ぶ「御影供」が行われている。後堂には不動明王坐像（貞観時代、国宝）が安置されている。
＊五重塔：1644（寛永21）年、徳川家光の再建。石壇上に立ち、各層3間四方、和様の復古建築。高さ約55mは、日本の木造建造物で最も高い。初層内部は板敷で中央に須弥壇を設け、大日如来に見立てた心柱を守るように金剛界四仏が鎮座する。格天井を張り、周囲の板壁には真言八祖像などがいずれも極彩色で描かれている。初層内部は春と秋の特別拝観時などに、一般公開される。
＊宝蔵：食堂の東にあり、周囲に堀を巡らす。3間四方、校倉造、平安時代の建築。
＊宝物館：春と秋、それぞれ約2か月、東寺に伝わる数多くの文化財を特別公開する。彫刻では、もと羅城門にあったと伝えられる国宝・兜跋毘沙門天立像をはじめ、もと食堂の本尊・千手観音立像など、絵画では真言七祖像、両界曼荼羅図など、工芸では弘法大師請来の密教法具類などの収蔵品から公開される。
＊東宝記：東寺の縁起・変遷を記す。8巻。南北朝時代に成立した東寺史として重要な書物である。
＊文覚上人：生没年不詳。鎌倉初期の真言宗の僧。上西門院の北面の武士であったが、源渡の妻、袈裟に横恋慕したあげく、誤って殺してしまったため、出家した。荒行を積み、高雄山寺（神護寺）の再興に力を尽くしたが、伊豆に流され、源頼朝の知遇を得た。のち佐渡、対馬に配流され、没す。
＊宣陽門院：1181～1252。 後白河法皇第6皇女。法皇から莫大な荘園を譲られ、政治にも参与。
＊土一揆：室町時代に盛んに行われた土民の支配権力に対する闘争。年貢の減免・借金の棒引き・代官の交替などを要求して強訴の形で行われ、暴動化して酒屋土倉を襲ったりした。
＊弘法市：835年（承和2年）3月21日（新暦では4月）に入定された弘法大師空海の報恩感謝のために毎月21日に行われる法会を「御影供」という。910年（延喜10年）に灌頂院で始められ、1240年（延応2年）からは御影堂でも行われるようになった。いつしか多くの人が集まるような「弘法市」となり、1,000店近くの露店が並び、大勢の人でにぎわう。
＊不二桜（ふじざくら）：盛岡市の旧家にあったサクラを、1994（平成6）年に鈴鹿市の農園に移植。空海の唐からの帰朝1,200年を記念して、2006（平成18）年に東寺に移植された。樹齢130年を超えるといわれ、高さ13m、枝張り約10m。紅シダレサクラで、サクラの名称は、空海の教えである「不二（ふに）の教え」からである。夜桜のライトアップも行われ、人気がある。