＊佐和口多聞櫓（さわぐちたもんやぐら）：入口に向かって左側は佐和山城から移したと伝える旧来からのもの。右側の櫓は、井伊直弼が桜田門外の変に散って100年目にあたる1960（昭和35）年、記念事業として二の丸佐和口多聞櫓跡に鉄筋造の櫓を復元した。※2023年12月現在非公開
＊馬屋：藩主などの馬20頭以上が繋がれていた。城内に残るのは彦根城だけ。2015年に保存修理された、こけら葺きの屋根が美しい。
＊廊下橋：鐘の丸と天秤櫓を結んで空堀をまたぐ。もと防備用の屋根があり廊下橋と呼ばれ、非常時には落とし橋になった。
＊天秤櫓（てんびんやぐら）：廊下橋を渡ると、橋を中心にして天秤のようにそれぞれ左右対称に二重櫓・隅櫓・多聞櫓が並び立つ。建物は羽柴秀吉の長浜城から移築したもの。石垣は右側が築城当時の牛蒡積（ごぼうづみ）、左は改修による整った石積。
＊太鼓門櫓（たいこもんやぐら）：戦国時代の迫力を感じさせる堅牢な城門が立つ。本丸表口の最終関門にあたるところから牙城（がじよう）の楼門とも呼ばれていた。旧藩時代は城内合図用の太鼓が置かれていた。櫓は旧彦根寺楼門で門柱の釘穴は順札が木札を打ちつけた跡と伝わるが、近年の解体修理では佐和山城城門との説もある。
＊天守閣：京極高次（きようごくたかつぐ）の大津城天色閣の移築で、付櫓と多聞櫓を脇に置く。1606（慶長11）年、彦根大工浜野喜兵衛（はまのきへえ）が着工、藩当初の十八万石に則り、城山の高さにもあわせて、高さ24mとやや小造りである。石垣は牛蒡積、天守の2・3層に花頭窓を開き、唐破風・千鳥格子などを縦横に駆使した変化のある配置。中に入れば通柱（とおしばしら）をさけた造り、隠狭間（かくしざま）など内部の細かな工夫がある。
＊三重櫓：本丸の西に連なる西の丸に立つ。浅井長政の小谷城（おだにじよう）天守閣の移築と伝わり、井伊直継の時代には木俣土佐守守勝（きまたとさのかみもりかつ）の預かりの櫓であった。
＊彦根城博物館：関ケ原で勇名をはせた赤備えをはじめとする鎧・刀などの武具、豪華な大名の調度品・幕末関係資料などがある。また茶・花・書・能・焼物など諸芸に親しんだ井伊直弼の手作りの盃・茶器・自筆の書・能装束なども興味深い。御座の間や茶室・庭園が復元され、館そのものが博物館として楽しめる。