熊本県北東部の阿蘇市、九州自動車道熊本ICから車で約1時間、JR豊肥本線宮地駅から北へ徒歩約15分にある。
　927（延長5）年に成立した延喜式神名帳に記載された式内社で、明治時代には官幣大社とされた。全国に約500社ある阿蘇神社の総本社であり、肥後国一の宮として社格の高さを誇る。神武天皇の孫神で阿蘇を開拓した健磐龍命（たけいわたつのみこと）を主神として、その妃の阿蘇都比咩命（あそつひめのみこと）、その子供である速瓶玉命（はやみかたまのみこと）など家族神12神を祀る。
　創建は紀元前282（孝霊天皇9）年と伝えられ、天文年間（1532～55）以来300年ほど仮社殿の状態が続いたが、1835（天保6）年から1850（嘉永3）年にかけて熊本藩主細川氏の援助により再建された。神殿や楼門など6棟が国の重要文化財に指定されている。
　2016（平成28）年の熊本地震で拝殿や楼門が全壊するなど社殿のほぼすべてが甚大な被害を受け、約7年8か月後の2023（令和5）年12月に楼門の保存修理工事を終え、主要な社殿の復旧と再建が完了した。
　阿蘇神社や関係神社に伝わる農耕祭事は、阿蘇の農耕祭事＊として国の重要無形民俗文化財に指定されている。