京阪本線七条駅から徒歩10分。東大路通に面し、石垣上に築地塀を廻らせ、表門、唐門を構える。幕末まで代々法親王が住持を務めた名刹で、天台三門跡の一つ（ほかは青蓮院と三千院）。広大な境内に国宝の庫裏、重要文化財の大書院や玄関、宸殿など多くの殿舎が立つ。建物内部は通常非公開で、2027（令和9）年まで庫裏改修工事のため境内にも入れない場合がある。
　平安時代末期、後白河法皇の護持僧であった比叡山本覚院の昌雲が、法皇の院御所・法住寺殿の近くに住坊を設けたのが始まりとされる。中世に入ると多くの争乱に巻き込まれて衰退したが、豊臣秀吉が方広寺大仏殿を造営した際、現在地に移転。大仏経堂に定められ、1595（文禄4）年に千僧供養が行われた。豊臣家滅亡後も徳川家に厚遇され、付近一帯の新日吉（いまひえ）神社、方広寺、三十三間堂を管理することとなり、豊臣家にまつわる貴重な遺物も伝えらえた。現在も妙法院は三十三間堂の本坊となっている。