JR嵯峨嵐山駅から徒歩20分、「百人一首」に詠われた小倉山＊の東麓にある。衆生を現世から来世へ送り出す「発遣（ほっけん）の釈迦」と、浄土へ迎え入れる「来迎の阿弥陀」の二尊＊を本尊に祀ることから、二尊院と呼ばれる。正式名称は小倉山二尊教院華臺寺。承和年間（834～847）、嵯峨天皇の勅願で慈覚大師円仁が建立した。のちに荒廃したが、法然が庵を結び、その弟子の湛空が再興した。第3世の湛空、第4世の叡空は天皇の帰依を受け、寺は隆盛したが、応仁の乱で伽藍を焼失。1521（永正18）年に三条西実隆らの力で復興された。近世には、公家の二条家・三条家・三条家・鷹司家や、豪商の角倉家などを檀家に迎えて大いに栄えた。
　境内は小倉山の東麓を占める。入口に立つどっしりとした総門は、角倉了以が伏見城の薬医門を移したもの。ここから長く延びる参道には楓と桜が交互に植えられ、「紅葉の馬場」とも「桜の馬場」ともいわれ、春は桜、秋は見事な紅葉に染まる。本堂＊は堂々として優美な佇まい。本堂背後の小倉山中腹には、土御門天皇・後嵯峨天皇・亀山天皇の分骨を納めた三帝陵、湛空の廟所がある。また保津川や高瀬川を開削した角倉了以・素庵父子、江戸時代の儒学者である伊藤仁斎・東涯父子、三条実万・実美父子など多数の名家、文人、学者の墓が立つ。この墓地を抜けたところは、藤原定家が「百人一首」を選定した山荘「時雨亭」の跡地とされる。